樊姓可能源自以国名、邑名为姓：西周畿内封国有樊，在今陕西长安县东南；春秋周邑有樊，初属郑，后又属晋，在今河南济源一带；嬴姓樊国，在今河南信阳一带；等等。此外，部分樊姓源自少数民族改姓，如巴郡南郡蛮五姓中即有樊氏。
早在秦汉时，樊姓就已广泛分布于河南各地：尉氏（今属河南）有农民起义将领樊并；南阳鲁阳（今河南鲁山）有术数名家樊英；义阳郡平氏县（今河南桐柏）有三国蜀汉尚书令樊建；南阳湖阳（今河南唐河）有寿张侯樊重一族；等等。
此外，泗水郡沛县（今江苏沛县）有舞阳侯樊哙一族；琅邪（今山东诸城）有赤眉军首领樊崇；凉州金城（治今甘肃永靖）有东汉末年军阀樊稠。
南北朝隋唐时有河东猗氏（今山西临猗）樊氏，代表人物有北魏中散大夫樊深；荆州襄阳（今湖北襄阳）有北魏骠骑大将军樊子鹄一族；庐江（治今安徽合肥）隋朝武威太守樊子盖；陈留（今河南开封）有隋朝司农卿樊叔略；安州安陆（今湖北安陆）有唐代左监门卫大将军樊兴一族；等等。